學院科研實力雄厚，成果豐碩。自2010年以來，學院主持承擔了國家863、國家973、國家現代農業產業技術體係崗位專家專項、國家公益性行業科研專項、國際合作重點項目、國家農業科技成果轉化資金專項、國家重大科技專項、國家傑出青年科學基金、國家自然科學重點基金、國家自然科學麵上項目等各類科研項目460餘項，累計到賬研究經費達4億元。在國家級學術期刊上發表論文2600餘篇，其中SCI收錄360餘篇，出版教材、專著40餘部，獲得專利30餘項。2004年以來，科研成果獲國家及省部級各級獎勵21項。
2004-2021年獲省（部）級三等獎以上科研獎勵情況
序號 | 成果名稱 | 主持人 | 獲獎名稱 | 獲獎 年份 |
1 | 豬重要經濟性狀功能基因的分離、克隆及應用研究 | 黃路生 | 江西省科技進步一等獎 | 2004 |
國家科技進步二等獎 | 2005 | |||
2 | 泰和烏骨雞綠色預混料配製技術的研究與應用 | 瞿明仁 | 江西省科技進步三等獎 | 2005 |
3 | 雞法氏囊及基三肽囊素（Barsin）免疫生物學的研究 | 諶南輝 | 江西省自然科學三等獎 | 2006 |
4 | 胚胎移植與性別控製技術的優化及基在優質奶、肉年高效生產中的應用 | 黃路生 | 江西省科技進步二等獎 | 2007 |
5 | 蜜蜂性比及營養雜交生物學特性研究 | 曾誌將 | 江西省自然科學三等獎 | 2007 |
6 | 大白豬抗應激高產仔綜合性能評估與選育技術研究 | 蘭旅濤 | 江西省科技進步三等獎 | 2008 |
7 | 蜜蜂性比及營養雜交生物學特性研究 | 曾誌將 | 江西省自然科學三等獎 | 2008 |
8 | 家豬複雜性狀的遺傳解析 | 黃路生 | 江西省自然科學一等獎 | 2009 |
9 | 仔豬斷奶前腹瀉抗病育種技術的創建及應用 | 黃路生 | 江西省技術發明一等獎 | 2010 |
國家技術發明二等獎 | 2010 | |||
10 | 家豬數量性狀的遺傳解析 | 黃路生 | 江西省自然科學一等獎 | 2011 |
11 | 蜜蜂高效養殖及其產品研究與應用 | 曾誌將 | 江西省科技進步二等獎 | 2012 |
12 | 蛋雞脂肪肝出血綜合征發病機製及其防控研究 | 胡國良 | 江西省自然科學三等獎 | 2012 |
13 | 種豬遺傳改良團隊 | 黃路生 | 中華農業科技獎優秀創新團隊 | 2012 |
14 | 警犬良種保純與高效繁育關鍵技術研究與推廣應用 | 麻駿武 | 國家科技進步二等獎 | 2015 |
15 | 畜禽飼料中大豆蛋白源抗營養因子研究與應用 | 遊金明 | 國家科技進步二等獎 | 2015 |
16 | 黑尾近紅鮊規模化育苗與健康養殖技術研究示範 | 周秋白 | 江西省科技進步三等獎 | 2015 |
17 | 蜜蜂仿生免移蟲產漿和育王新技術 | 曾誌將 | 江西省技術發明獎二等獎 | 2016 |
18 | 蜜蜂生物學理論中若幹問題研究 | 曾誌將 | 江西省自然科學二等獎 | 2018 |
19 | 在農業科技進步、促進我國農業和農村經濟發展中做出突出貢獻 | 黃路生 | 中華農業英才獎 | 2018 |
20 | 在基礎研究和前沿探索領域作出突出貢獻 | 黃路生 | 全國創新爭先獎 | 2020 |
| 21 | 仔豬腸道屏障功能及機體免疫調控關鍵技術研發與應用 | 遊金明 | 江西省科技進步獎一等獎 | 2021 |
